Schröter war zuvor fünf Jahre lang Leiter Technik und Innovation bei den Muldentalkliniken und arbeitete davor 18 Jahre lang bei einem großen deutschen Facility Management-Dienstleister. Er trug unter anderem die Verantwortung für Nebenprozesse aller Branchen, unter anderem für Forschung und Entwicklung (Universität Ilmenau, Fraunhofer Dresden) oder auch das Fußballstadion in Magdeburg. Zudem hatte Matthias Schröter von 2010 bis 2020 einen Lehrauftrag an der Hochschule Anhalt inne und übernahm dort zwischenzeitlich eine Vertretungsprofessur für Facility Services.
Matthias Schröter ist Vorstand des Akademischen Orchesters Leipzig e.V. und dessen Solocellist.